是測序(xu)產業(ye)(ye)鏈(lian)的(de)起點也是關鍵環節，它為整個中下游測序(xu)服務提(ti)供基本的(de)測序(xu)支(zhi)撐，同時(shi)也處于基因(yin)測序(xu)產業(ye)(ye)價值(zhi)鏈(lian)頂(ding)端。基因(yin)測序(xu)儀(yi)對于基因(yin)產業(ye)(ye)的(de)重(zhong)要(yao)性(xing)，如(ru)同發動機之于汽車行(xing)業(ye)(ye)，芯片之于電子通信行(xing)業(ye)(ye)。

基因測(ce)序也稱DNA測(ce)序，是現代生(sheng)物學研究(jiu)中重要的手段之一。基因測(ce)序技術經(jing)過了(le)三(san)個發展階段。

一代測序(xu)：指雙脫氧末端(duan)終止法，擴增(zeng)后通過毛細管(guan)電泳(yong)讀取序(xu)列(lie)，每次獲取數據量少。

二代測序：為高通量(liang)測序，采用微珠或(huo)高密(mi)度芯片邊(bian)合成邊(bian)測序，代表有454，Solexa，SOLID，高通量(liang)，可一次獲(huo)得數G數據(ju)，相對與第三代，都仍然(ran)需(xu)要(yao)擴增的方法(fa)放大信號，擴增后再(zai)檢測。

三代(dai)測序(xu)：特點是單分(fen)(fen)子測序(xu)，多基(ji)于納(na)米科技(ji)，無(wu)需擴(kuo)增，對單分(fen)(fen)鏈(lian)DNA/RNA直接(jie)用合成、降解(jie)、通過納(na)米孔等(deng)方源式直接(jie)測序(xu)，核心特點是無(wu)需擴(kuo)增所以成本更低。

二(er)手(shou)基因測序儀 二(er)代技(ji)術中有(you)哪(na)些(xie)品牌(pai)突出？有(you)哪(na)些(xie)性(xing)能優勢？

Roche公司的(de)454測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)平臺(tai)、Illumina公司的(de)Solexa測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)系(xi)(xi)統(tong)(tong)以及ABI公司的(de)SOLID測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)系(xi)(xi)統(tong)(tong)標志著(zhu)二代(dai)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)技(ji)術誕生。盡管各系(xi)(xi)統(tong)(tong)在(zai)高通量水(shui)平、測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)準確度、存儲格式(shi)、技(ji)術方(fang)法上各有差異(yi)，但共同特征是大(da)大(da)降(jiang)低了測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)成本并大(da)大(da)地提高了測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)速度，完成一(yi)個(ge)人(ren)的(de)基(ji)(ji)因組測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)只需(xu)一(yi)周左右時(shi)間(jian)。然而二代(dai)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)技(ji)術在(zai)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)前要通過PCR段對(dui)待測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)片段進行(xing)擴(kuo)增(zeng)，增(zeng)加了測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)的(de)錯(cuo)誤率。而且二代(dai)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)產(chan)生的(de)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)結果長度較短，需(xu)要對(dui)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)結果進行(xing)人(ren)工拼接，因此比(bi)較適合于對(dui)已知(zhi)序(xu)(xu)(xu)(xu)列的(de)基(ji)(ji)因組進行(xing)重(zhong)新測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)，而在(zai)對(dui)全新的(de)基(ji)(ji)因組進行(xing)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)時(shi)還需(xu)要結合一(yi)代(dai)測(ce)(ce)(ce)(ce)(ce)序(xu)(xu)(xu)(xu)技(ji)術。

簡而言(yan)之： Roche 454是焦磷酸測(ce)序(xu)； illumina Solexa是合成法(fa)測(ce)序(xu)； ABI SOLID是連接法(fa)測(ce)序(xu)。

就讀長來看： Roche 454 > illumina Solexa > ABI SOLID。

就(jiu)Reads數來(lai)看： ABI SOLID > illumina Solexa > Roche 454。

就應用(yong)來(lai)看(kan)： Roche 454讀長(chang)(chang)較長(chang)(chang)，便(bian)于(yu)拼接 ，因此在denovo測序方面有(you)很(hen)大優勢(shi)；ABI SOLID雖(sui)然讀長(chang)(chang)很(hen)短，但是Reads數多，而(er)且ABI的(de)色球編(bian)碼(ma)技術(shu)，使得每個堿(jian)基(ji)都會被讀取兩(liang)遍，準(zhun)確(que)率很(hen)腐(fu)， 因此ABI SOL心在檢測SNP、轉錄組測序、ChIP-Seq等方面很(hen)有(you)優勢(shi)；illumina Solexa的(de)讀長(chang)(chang)和Reads數均位于(yu)中間，比較適合(he)于(yu)基(ji)因組重測序。而(er)在實際應用(yong)中 ，由千Roche 454成(cheng)本(ben)太(tai)商，因此illumina Solexa 也被較多的(de)應用(yong)于(yu)denovo測序。